Overview 在处理fasta格式序列的过程中，我们经常会发现得到的fasta格式并不是很标准，比如有一个fasta文件中有多条这样形式的序列： >gi|28898692|ref|NP_798297.1| hypothetical protein VP1918 [Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633]|1 MKKTTLMSAVVATLSLVGC...阅读全文>>

Overview 在 BioPerl（一）：安装BioPerl 中我们不只安装了BioPerl，还给出了一个使用BioPerl的手动构造了一个Bio::Seq对象的例子，这个对象中包含了我们手动填入的fasta格式的信息。既然可以手动构造，那么也就可以从fasta文件中读取序列信息，由BioPerl自动填充成Bio::Seq对象。 1. 使用BioPerl读取单条fasta序列 我们有一个...阅读全文>>

Overview 今天闲暇之余，看到了一篇关于BioPerl的博客 初品BioPerl（第三篇：从本地文件中获取fasta序列），发现BioPerl可以让很多事变得简单，fasta格式处理起来也事半功倍。 其实宋老师之前已经跟我提过BioPerl了，只不过我一直以任务为导向，觉得perl脚本就够处理，所以一直也没去了解。好东西自然马上就要用起来，我也马上装上了BioPerl，这里记录下来B...阅读全文>>