蛋白质序列处理过程中需要用到部分生物化学的知识，经过Chris的点拨和自己的查阅，现将这些基础知识记录下来。

氨基酸(amino acid)

生物体内的各种蛋白质是由20种基本氨基酸构成的，它们均为α－氨基酸，详细情况如下：

也就是说，我们用字母表中，除了B,J,O,U,X,Z之外其他20个大写字母表示了这20种基本氨基酸，再看到诸如LEEYRKHVAERAAEGIAPKPLDANQMAALVELLKNPPAGEEEFLLDLLTN这样的序列的时候，就不会找不着头绪了。
更多知识请点击：氨基酸和氨基酸的简写符号

肽(peptide)

肽(peptide)是α－氨基酸以肽键连接在一起而形成的化合物，它也是蛋白质水解的中间产物，氨基酸，多肽，蛋白质的关系如下：氨基酸→多肽→蛋白质。
α－氨基酸是氨基(-NH2)和羧基(-COOH)连接在同一个碳原子上的氨基酸。氨基和其他氨基酸的羧基通过缩水反应形成肽链，进而产生多肽。
关于多肽请点击:肽(Peptide)

• N-端氨基酸序列N-terminal amino acid sequence，是指蛋白质或多肽链中具有游离氨基的一端；
  
• C-端氨基酸序列C-terminal amino acid sequence，是指蛋白质或多肽链中具有游离羧基的一端。
  

关于N-端和C-端，请点击：
http://academic.brooklyn.cuny.edu/biology/bio4fv/page/c_and_n_.htm
https://en.wikipedia.org/wiki/N-terminus
https://en.wikipedia.org/wiki/C-terminus

泛素(Ubiquitin)与泛素化(Ubiquitination)

泛素(Ubiquitin)是一种存在于大多数真核细胞中的小蛋白。它的主要功能是标记需要分解掉的蛋白质，使其被水解。当附有泛素的蛋白质移动到桶状的蛋白酶的时候，蛋白酶就会将该蛋白质水解。
泛素化(Ubiquitination)是一种酶促的、蛋白质翻译后修饰（post-translational modification）过程，其中来自被激活泛素的二甘氨酸模体中末端甘氨酸的羧基与被修饰蛋白中赖氨酸ε氨基相连形成一酰胺键。
详情请点击：中文维基百科和英文维基百科。

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