Overview Diffuser是一个基于分布式的生物序列特征生成网站，因此需要在每个单一节点安装所需的软件：ViennaRNA-2.4.8，VSL2，psipred和spineX。本文以deepamp节点为例，分别安装和配置以上4个软件。 1. 安装ViennaRNA-2.4.8 该软件用于预测RNA序列结构，安装步骤如下： wget https://www.tbi.univie.ac...阅读全文>>

Overview 之前安装过很多次的phpMyAdmin，但最近一次安装时，出现了一个之前从来没遇到的问题：访问phpMyAdmin时，主页的php页面会被不能被解析成网页，而是直接显示了页面代码。 问题描述 文字描述已经比较清楚了，就不截图了。如果想看截图，参考 phpmyadmin showing php script [duplicate]。 对比之前的安装流程，发现这次安装Apac...阅读全文>>

Overview 因为想尝试一些深度学习模型，就用Keras开始建模（为什么使用Keras？）。而且由于之前使用的极其模型都是基于R语言的，所以我们依然尝试使用R语言版本的Keras来训练深度学习模型。 Keras的R语言接口 Keras本身就是一个基于Tensorflow、Theano以及CNTK编写的纯Python框架，因为方便易用，所以使用广泛，为了让R语言开发者也能在R中使用Ke...阅读全文>>

Overview 今天在服务器（Ubuntu 16.04）使用pip安装深度学习包Keras的时候，发现安装结束之后下面有一行提示小字，大约就是pip有新版本可以更新，使用XXX命令更新，就顺带更新了一下，更新完了pip就不能用了... 问题描述 及时是查看下pip的版本 sudo pip --version 也会报下面的错误： Traceback (most recent call l...阅读全文>>